Lors du déclenchement de la guerre de libération le 1er novembre 1954, le secteur de la santé était quasiment inexistant. Même la formation des cadres de la santé au cours de cette étape était dans son ensemble rudimentaire. De ce fait, la première étape de la Révolution qui va de 1954 à 1956 a énormément souffert dans ce domaine sensible et essentiel et cela dura jusqu'à la grève des étudiants le 19 mai 1956, une fois que ces derniers eurent rejoint les rangs de la Révolution et qu'ils apportèrent un second souffle au secteur de la santé par le biais des nombreux étudiants en médecine et pharmacie ainsi que les élèves infirmiers qui avaient rejoint ses rangs.

Le premier noyau dans le domaine de la santé durant la Révolution fut formé à partir de la grève estudiantine, le 19 mai 1956 qui a permis aux rangs de la Révolution d'être renforcés par des spécialistes dans le secteur de la santé.
La constitution du premier noyau de la santé pendant la Révolution amena les étudiants à assumer la responsabilité de la prise en charge effective du secteur de la santé. Leur mission fut d'abord de fournir l'assistance médicale nécessaire et indispensable aux moudjahidine blessés pour être ensuite étendue vers la partie civile de la population, à travers les visites médicales effectuées auprès des civils malades dans les villages, les hameaux et les campagnes.

Le secteur de la santé est passé par des étapes historiques qui furent à l'origine de son évolution et de son changement qualitatif. Ainsi s'être limités au début aux soins primaires, les spécialistes de la santé qui avaient rejoint la Révolution créèrent de nombreux hôpitaux, qui furent au départ des hôpitaux pilotes dont les prémisses apparurent à la wilaya II historique .
Cependant , l'évolution de la situation intérieure à travers l'augmentation des effectifs militaires français dans tous les corps d'armée de terre, la marine et de l'air a induit la mise en place d'un autre type d'hôpitaux, à savoir les hôpitaux mobiles.
L'objectif essentiel de cette démarche est d'éviter que l'ennemi ne s'empare des médicaments et appareils médicaux lorsque de tels centres sont découverts. Pour tenter de venir à bout de ce noyau initial de la santé, les autorités coloniales ont imposé une surveillance étroite au niveau des frontières dont l'objectif était d'interdire les produits à caractère médical destinés à l'Algérie et de procéder à leur saisie afin qu'ils ne parviennent pas aux mains des moudjahidine.
Il existe à ce propos des exemples de sanctions infligées par les autorités coloniales aux Algériens en raison de leur implication dans le soutien à la Révolution par la fourniture des médicaments et de matériel médical arrivés à travers les frontières Est et Ouest.

Après achèvement de l'encadrement du secteur de la santé durant la lutte de libération, à partir de 1956 et compte tenu des conditions difficiles vécues par les réfugiés algériens, il était devenu impératif pour le Front de Libération Nationale de porter à la connaissance de tous les peuples du monde les conditions dramatiques vécues par les Algériens à l'intérieur du pays, du fait de la politique répressive appliquée de concert par l'administration et l'armée française qui a poussé de nombreux algériens à l'exil vers des pays frères voisins notamment vers le Maroc et la Tunisie.
L'objectif étant d'obtenir les aides nécessaires et indispensables en vue d'améliorer la situation des réfugiés, il fut procédé à la création d'une instance du secteur de la santé dont la mission consisterait à jouer un rôle patriotique et humanitaire. Le Croissant Rouge Algérien fut donc créé deux ans après le déclenchement de la Révolution Algérienne.
Les consignes du Front de Libération Nationale aux membres du bureau du Croissant Rouge Algérien étaient claires et consistaient en l'exigence pour eux de ne pas s'écarter de l'idéologie du FLN visant à éclairer le monde sur le drame du peuple algérien, d'informer de ses souffrances les peuples et les gouvernements du monde entier ainsi que ses organisations humanitaires. La ville marocaine de Tanger fut retenue pour accueillir le siège du Croissant Rouge Algérien qui fut transféré par la suite à Tunis en 1957.

Les consignes du Front de Libération Nationale étaient claires, à savoir faire parvenir au monde la voix des Algériens et informer le monde de leurs souffrances. C'est là que résidaient essentiellement les missions du Croissant Rouge Algérien. Elles consistaient à dévoiler la politique du colonialisme français qui avait fait fi de toutes les coutumes et lois internationales et qui fut la cause de l'exil et du déracinement des Algériens les poussant à abandonner leurs terres, leurs villages, leurs villes dans le seul but de vider la Révolution de son contenu populaire. Ce sont ces missions bien précises qui ont sous-tendu la création de cette organisation humanitaire.

Après le transfert en 1957 du siège du Croissant Rouge Algérien de Tanger au Maroc vers Tunis sur ordre du Comité de Coordination et d'Exécution, les membres du bureau du Croissant Rouge Algérien furent désignés et chargés de gérer et veiller à l'exécution des ordres du Front de Libération Nationale dans le suivi de la situation, et enfin d'œuvrer à acquérir un soutien plus large des organisations humanitaires dans le monde et à leur tête la Croix Rouge Internationale.